يركّز القسم على تزويد الطلبة بالأسس النظرية والتطبيقية في الإلكترونيات الطبية، وأنظمة القياس والسيطرة، والمجسات الطبية، والأجهزة التشخيصية والعلاجية، والهندسة الطبية الحياتية، إضافة إلى تدريبهم على التعامل مع الأجهزة الطبية الحديثة المستخدمة في المستشفيات والمراكز الصحية، مع الالتزام بمعايير السلامة والجودة المعتمدة.
يعتمد القسم على مناهج دراسية حديثة تجمع بين الجانب الأكاديمي والتطبيق العملي داخل المختبرات المتخصصة، وبإشراف كادر تدريسي يمتلك خبرة علمية ومهنية. كما يحرص على تنمية مهارات التحليل الهندسي، وحل المشكلات الفنية، والعمل ضمن الفريق الطبي والهندسي.
يسعى قسم هندسة تقنيات الأجهزة الطبية إلى تخريج مهندسين تقنيين قادرين على العمل بكفاءة في المستشفيات، والمراكز الطبية، وشركات تجهيز وصيانة الأجهزة الطبية، والمؤسسات الصحية الحكومية والأهلية، والمساهمة في تحسين جودة الخدمات الصحية ودعم المنظومة الطبية بخبرات تقنية متخصصة.